Otto Malpense on üç yaşında olsa da yaşadığı yetimhaneyi yönetmektedir ve ülkedeki en güçlü adamı kandırmak için harika bir planı vardır. Özetle, dünyanın bir sonraki süper kötüsü olmak için harika bir adaydır.
Tam da bu nedenle kendisini, öğrencileri itinayla seçilmiş Koza isimli bir okulda bulur. Bu yer, bir adadaki aktif bir volkanın içinde on yıllardır gizli bir şekilde hizmet vermektedir.
Okulun öğrencileri belirgin özelliklere sahiptir, bazıları çok atletiktir ancak bazıları da teknoloji bilgisi ve zeka seviyesi açısından eşsizdir.
Koza’da devasa mağaraların içine oyulmuş sınıflar, birbirinden tuhaf öğretmenler ve dersler vardır. Ama Otto, burada eğitiminin altı yıl boyunca devam edeceğini ve okuldan ayrılmak gibi bir seçeneğinin olmadığını fark eder.
Otto birbirinden acayip yeteneklere sahip yeni arkadaşlarıyla birlikte, daha önce kimsenin kaçamadığı Koza’dan çıkmayı başarabilecek midir?