Matilda bilime ve icatlara bayılır. Marie Curie, Leonardo Da Vinci ve Thomas Edison onun kahramanlarıdır ve bir gün kendisi de ünlü bir mucit olmayı istemektedir. Okuldaki bilim yarışmasını adaletsizlik yüzünden kazanamayınca çok üzülür. Özellikle de jüri yarışmaya katıldığı icadı kendisinin yaptığına inanmayınca. Çünkü o bir kızdır.
Matilda duygularını büyükannesi Joss ile paylaşır ve büyükannesinin de bir zamanlar bilim insanı olduğunu öğrenince çok şaşırır. Büyükannesi kendi gezegenini keşfetmiş olan bir astrofizikçidir!
Sorun, hiç kimsenin büyükanne Joss’a inanmamasıdır. Araştırmanın başındaki Profesör Smocks, kadının keşfini çalmıştır. Ve bu keşifle dünyanın en büyük, en ünlü bilim ödülü olan Nobel Ödülü’nü almak üzeredir.
Matilda gerçeği herkese anlatmaya kararlıdır… Fakat o ve büyükannesi törene zamanında yetişmeyi başarabilecekler midir?